Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM47EQ6ZV65 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM47EQ6ZV65 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM47EQ6ZV65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47EQ6ZV65 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms