Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
UBR3Q6ZT12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
UBR3Q6ZT12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
UBR3Q6ZT12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UBR3Q6ZT12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
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