Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6Q795 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6Q795 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6Q795 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6Q795 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6Q795 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6Q795 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6Q795 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6Q795 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6Q795 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6Q795 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6Q795 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q6Q795 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6Q795 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6Q795 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6Q795 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6Q795 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6Q795 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6Q795 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6Q795 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6Q795 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6Q795 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6Q795 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6Q795 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6Q795 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6Q795 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6Q795 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6Q795 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6Q795 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6Q795 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6Q795 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6Q795 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6Q795 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms