Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRGCQ6NXR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRGCQ6NXR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRGCQ6NXR0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms