Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMBOX1Q6NT76 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMBOX1Q6NT76 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMBOX1Q6NT76 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms