Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN13Q6MZZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN13Q6MZZ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN13Q6MZZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms