Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CARMIL2Q6F5E8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CARMIL2Q6F5E8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL2Q6F5E8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CARMIL2Q6F5E8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL2Q6F5E8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CARMIL2Q6F5E8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms