Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPECC1LQ69YQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPECC1LQ69YQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPECC1LQ69YQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPECC1LQ69YQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPECC1LQ69YQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms