Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P5Q5VTE0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms