Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NHSL1Q5SYE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NHSL1Q5SYE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NHSL1Q5SYE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NHSL1Q5SYE7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NHSL1Q5SYE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NHSL1Q5SYE7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NHSL1Q5SYE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NHSL1Q5SYE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms