Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD55Q3KP44 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD55Q3KP44 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD55Q3KP44 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms