Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STX1AQ16623 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
STX1AQ16623 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STX1AQ16623 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms