Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRK1Q15835 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRK1Q15835 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRK1Q15835 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms