Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
GAPVD1Q14C86 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
GAPVD1Q14C86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
GAPVD1Q14C86 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GAPVD1Q14C86 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
GAPVD1Q14C86 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
GAPVD1Q14C86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GAPVD1Q14C86 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
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