Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC1AQ14683 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC1AQ14683 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC1AQ14683 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC1AQ14683 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMC1AQ14683 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC1AQ14683 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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