Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-7■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 313.57□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 LONP1-211ENST00000590558 2884 ntTSL 517.26■□□□□ 0.351e-15■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-15■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 ADNP2-204ENST00000560752 880 ntTSL 529.52■■■□□ 2.325e-14■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.455e-14■■■■□ 19.3
GRSF1Q12849 TTC6-205ENST00000533625 3567 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-10■■■□□ 19.2
GRSF1Q12849 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.013e-10■■■□□ 19.2
GRSF1Q12849 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-10■■■□□ 19.2
GRSF1Q12849 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 219.2■□□□□ 0.663e-6■■■□□ 19.2
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GRSF1Q12849 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.567e-9■■■□□ 19.1
GRSF1Q12849 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 19
GRSF1Q12849 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 19
GRSF1Q12849 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 19
GRSF1Q12849 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 19
GRSF1Q12849 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.047e-14■■■□□ 19
GRSF1Q12849 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-14■■■□□ 19
GRSF1Q12849 TMBIM1-219ENST00000465082 2874 ntTSL 212.39□□□□□ -0.437e-14■■■□□ 19
GRSF1Q12849 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.567e-14■■■□□ 19
GRSF1Q12849 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.216e-7■■■□□ 18.9
GRSF1Q12849 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.756e-7■■■□□ 18.9
GRSF1Q12849 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.746e-7■■■□□ 18.9
GRSF1Q12849 NIPA2-210ENST00000561072 574 ntTSL 427.01■■□□□ 1.915e-12■■■□□ 18.8
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GRSF1Q12849 NIPA2-207ENST00000560039 554 ntTSL 423.56■■□□□ 1.365e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.285e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-209ENST00000560762 534 ntTSL 522.88■■□□□ 1.255e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.255e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-208ENST00000560205 589 ntTSL 422.77■■□□□ 1.245e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.985e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.175e-12■■■□□ 18.8
GRSF1Q12849 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.057e-17■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.727e-17■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.477e-17■■■□□ 18.7
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GRSF1Q12849 DHRS2-207ENST00000556701 3157 ntTSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.17e-17■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 DHRS2-203ENST00000432832 834 ntTSL 221.13■□□□□ 0.971e-16■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-9■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 PACSIN3-210ENST00000533686 443 ntTSL 316.99■□□□□ 0.313e-9■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 319.75■□□□□ 0.752e-13■■■□□ 18.7
GRSF1Q12849 HNRNPM-205ENST00000596295 910 ntTSL 318.93■□□□□ 0.626e-19■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 CEP250-207ENST00000425934 2156 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-9■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 CEP250-209ENST00000461386 2295 ntTSL 213.59□□□□□ -0.232e-9■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-9■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.943e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.183e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.13e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.143e-10■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.246e-83■■■□□ 18.6
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GRSF1Q12849 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.796e-83■■■□□ 18.6
GRSF1Q12849 PUS1-204ENST00000456665 577 ntTSL 525.28■■□□□ 1.641e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 525.28■■□□□ 1.641e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-207ENST00000538037 631 ntTSL 523.35■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-211ENST00000544662 836 ntTSL 322.97■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-201ENST00000322060 1206 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.04■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 315.64■□□□□ 0.091e-18■■■□□ 18.5
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GRSF1Q12849 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.261e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-211ENST00000495878 2758 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.361e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.851e-18■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-8■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-8■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■■■□□ 18.5
GRSF1Q12849 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.577e-9■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 522.47■■□□□ 1.197e-9■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.617e-9■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 517.06■□□□□ 0.327e-9■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.494e-8■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.464e-8■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.484e-8■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.579e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.559e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 516.59■□□□□ 0.259e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.139e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.039e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 PCYOX1-203ENST00000422380 556 ntTSL 413.35□□□□□ -0.279e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 PCYOX1-202ENST00000414812 957 ntTSL 313.08□□□□□ -0.329e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.619e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 PCYOX1-205ENST00000451279 648 ntTSL 49.5□□□□□ -0.899e-10■■■□□ 18.4
GRSF1Q12849 FAM214A-206ENST00000561543 931 ntTSL 326.58■■□□□ 1.851e-6■■■□□ 18.3
GRSF1Q12849 FAM214A-205ENST00000561490 547 ntTSL 41.57□□□□□ -2.161e-6■■■□□ 18.3
GRSF1Q12849 FAM214A-209ENST00000566768 576 ntTSL 31.2□□□□□ -2.221e-6■■■□□ 18.3
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