RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.35■■■■□ 3.89
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.79■■■■□ 3.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCC9O60706 1549 aa33.72■■■□□ 2.99
PACSIN3-210ENST00000533686 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
PACSIN3-210ENST00000533686 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.72■■■□□ 2.83
PACSIN3-210ENST00000533686 NACADO15069 1562 aa32.68■■■□□ 2.82
PACSIN3-210ENST00000533686 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.64■■■□□ 2.82
PACSIN3-210ENST00000533686 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.61■■■□□ 2.81
PACSIN3-210ENST00000533686 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.61■■■□□ 2.81
PACSIN3-210ENST00000533686 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.77■■■□□ 2.68
PACSIN3-210ENST00000533686 SCRIBQ14160 1630 aa31.74■■■□□ 2.67
PACSIN3-210ENST00000533686 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.659e-7■□□□□ 8.3
PACSIN3-210ENST00000533686 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.6■■■□□ 2.65
PACSIN3-210ENST00000533686 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.37■■■□□ 2.61
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.69■■■□□ 2.5
PACSIN3-210ENST00000533686 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.6■■■□□ 2.49
PACSIN3-210ENST00000533686 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.51■■■□□ 2.48
PACSIN3-210ENST00000533686 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PACSIN3-210ENST00000533686 SMARCA4P51532 1647 aa30.42■■■□□ 2.46
PACSIN3-210ENST00000533686 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.31■■■□□ 2.44
PACSIN3-210ENST00000533686 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.22■■■□□ 2.43
PACSIN3-210ENST00000533686 SMARCA2P51531 1590 aa30.19■■■□□ 2.42
PACSIN3-210ENST00000533686 NCAPD3P42695 1498 aa30.19■■■□□ 2.42
PACSIN3-210ENST00000533686 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.16■■■□□ 2.42
PACSIN3-210ENST00000533686 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
PACSIN3-210ENST00000533686 HMGXB3Q12766 1538 aa30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-210ENST00000533686 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-210ENST00000533686 WIZO95785 1651 aa29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-210ENST00000533686 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
PACSIN3-210ENST00000533686 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.37■■■□□ 2.29
PACSIN3-210ENST00000533686 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.32■■■□□ 2.28
PACSIN3-210ENST00000533686 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.28■■■□□ 2.28
PACSIN3-210ENST00000533686 NESP48681 1621 aa29.27■■■□□ 2.28
PACSIN3-210ENST00000533686 CFTRP13569 1480 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-210ENST00000533686 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.11■■■□□ 2.25
PACSIN3-210ENST00000533686 ERCC6Q03468 1493 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-210ENST00000533686 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-210ENST00000533686 PRDM2Q13029 1718 aa28.89■■■□□ 2.21
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.88■■■□□ 2.21
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.87■■■□□ 2.21
PACSIN3-210ENST00000533686 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.77■■■□□ 2.2
PACSIN3-210ENST00000533686 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PACSIN3-210ENST00000533686 CUX2O14529 1486 aa28.66■■■□□ 2.18
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR62O43379 1518 aa28.65■■■□□ 2.18
PACSIN3-210ENST00000533686 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCC8Q09428 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
PACSIN3-210ENST00000533686 TOPBP1Q92547 1522 aa28.51■■■□□ 2.15
PACSIN3-210ENST00000533686 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.5■■■□□ 2.15
PACSIN3-210ENST00000533686 CUX1P39880 1505 aa28.41■■■□□ 2.14
PACSIN3-210ENST00000533686 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
PACSIN3-210ENST00000533686 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PACSIN3-210ENST00000533686 IFT140Q96RY7 1462 aa28.27■■■□□ 2.12
PACSIN3-210ENST00000533686 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.27■■■□□ 2.12
PACSIN3-210ENST00000533686 TOP2BQ02880 1626 aa28.25■■■□□ 2.11
PACSIN3-210ENST00000533686 SYNJ1O43426 1573 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-210ENST00000533686 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-210ENST00000533686 SOGA1O94964 1423 aa28.21■■■□□ 2.11
PACSIN3-210ENST00000533686 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-210ENST00000533686 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.04■■■□□ 2.08
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR97A6NE52 1622 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-210ENST00000533686 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PACSIN3-210ENST00000533686 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.076e-8■■□□□ 14.3
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM41Q8WV44 630 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-210ENST00000533686 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-210ENST00000533686 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-210ENST00000533686 GRIN2BQ13224 1484 aa27.83■■■□□ 2.05
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF27Q86VH2 1401 aa27.77■■■□□ 2.04
PACSIN3-210ENST00000533686 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PACSIN3-210ENST00000533686 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3-210ENST00000533686 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-210ENST00000533686 PBRM1Q86U86 1689 aa27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-210ENST00000533686 IGF1RP08069 1367 aa27.64■■■□□ 2.02
PACSIN3-210ENST00000533686 SYNJ2O15056 1496 aa27.61■■■□□ 2.01
PACSIN3-210ENST00000533686 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-210ENST00000533686 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-210ENST00000533686 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-210ENST00000533686 FBLN2P98095 1184 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-210ENST00000533686 OSCARQ8IYS5 282 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAMTS12P58397 1594 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-210ENST00000533686 CHD1O14646 1710 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-210ENST00000533686 EEA1Q15075 1411 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-210ENST00000533686 CUL7Q14999 1698 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-210ENST00000533686 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-210ENST00000533686 GRIN2AQ12879 1464 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-210ENST00000533686 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-210ENST00000533686 NUP160Q12769 1436 aa27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3-210ENST00000533686 PRXQ9BXM0 1461 aa27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3-210ENST00000533686 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-210ENST00000533686 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-210ENST00000533686 CEP170Q5SW79 1584 aa27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-210ENST00000533686 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-210ENST00000533686 KIF21BO75037 1637 aa27.11■■□□□ 1.93
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