Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFFO1Q0D2I5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFFO1Q0D2I5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFFO1Q0D2I5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFFO1Q0D2I5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms