Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN1BQ07699 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN1BQ07699 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms