Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF85Q03923 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF85Q03923 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF85Q03923 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF85Q03923 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF85Q03923 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF85Q03923 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms