Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ID3Q02535 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ID3Q02535 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ID3Q02535 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ID3Q02535 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ID3Q02535 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ID3Q02535 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ID3Q02535 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ID3Q02535 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ID3Q02535 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ID3Q02535 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ID3Q02535 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ID3Q02535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ID3Q02535 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ID3Q02535 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ID3Q02535 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ID3Q02535 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ID3Q02535 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ID3Q02535 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ID3Q02535 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ID3Q02535 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ID3Q02535 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ID3Q02535 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ID3Q02535 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ID3Q02535 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ID3Q02535 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ID3Q02535 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ID3Q02535 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ID3Q02535 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ID3Q02535 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ID3Q02535 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ID3Q02535 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ID3Q02535 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ID3Q02535 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ID3Q02535 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ID3Q02535 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ID3Q02535 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ID3Q02535 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ID3Q02535 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ID3Q02535 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ID3Q02535 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ID3Q02535 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ID3Q02535 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ID3Q02535 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ID3Q02535 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ID3Q02535 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ID3Q02535 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ID3Q02535 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ID3Q02535 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ID3Q02535 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ID3Q02535 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ID3Q02535 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ID3Q02535 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ID3Q02535 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ID3Q02535 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ID3Q02535 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ID3Q02535 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ID3Q02535 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ID3Q02535 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ID3Q02535 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ID3Q02535 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ID3Q02535 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ID3Q02535 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ID3Q02535 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ID3Q02535 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ID3Q02535 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ID3Q02535 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ID3Q02535 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ID3Q02535 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ID3Q02535 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ID3Q02535 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ID3Q02535 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ID3Q02535 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ID3Q02535 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ID3Q02535 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms