Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA5Q01523 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA5Q01523 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA5Q01523 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DEFA5Q01523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DEFA5Q01523 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DEFA5Q01523 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA5Q01523 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA5Q01523 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms