Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MDM2Q00987 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MDM2Q00987 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MDM2Q00987 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MDM2Q00987 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms