Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSNK2BP67870 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2BP67870 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2BP67870 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms