Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX9P55771 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX9P55771 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX9P55771 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAX9P55771 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAX9P55771 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PAX9P55771 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX9P55771 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX9P55771 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX9P55771 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX9P55771 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX9P55771 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX9P55771 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PAX9P55771 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX9P55771 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX9P55771 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX9P55771 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX9P55771 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX9P55771 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX9P55771 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX9P55771 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX9P55771 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX9P55771 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX9P55771 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX9P55771 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX9P55771 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX9P55771 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX9P55771 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX9P55771 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX9P55771 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX9P55771 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX9P55771 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX9P55771 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX9P55771 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX9P55771 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX9P55771 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX9P55771 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX9P55771 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX9P55771 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX9P55771 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX9P55771 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX9P55771 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX9P55771 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX9P55771 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX9P55771 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX9P55771 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX9P55771 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX9P55771 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX9P55771 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX9P55771 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX9P55771 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX9P55771 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX9P55771 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX9P55771 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX9P55771 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX9P55771 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX9P55771 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX9P55771 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX9P55771 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX9P55771 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX9P55771 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX9P55771 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX9P55771 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms