Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS2P54278 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS2P54278 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMS2P54278 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P54278 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P54278 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P54278 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P54278 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P54278 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMS2P54278 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P54278 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P54278 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P54278 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P54278 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMS2P54278 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P54278 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMS2P54278 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS2P54278 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS2P54278 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS2P54278 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMS2P54278 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS2P54278 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS2P54278 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PMS2P54278 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS2P54278 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS2P54278 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS2P54278 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PMS2P54278 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P54278 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P54278 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P54278 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P54278 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P54278 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P54278 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS2P54278 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PMS2P54278 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMS2P54278 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P54278 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P54278 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P54278 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PMS2P54278 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS2P54278 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS2P54278 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMS2P54278 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS2P54278 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS2P54278 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS2P54278 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS2P54278 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMS2P54278 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS2P54278 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS2P54278 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS2P54278 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS2P54278 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS2P54278 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS2P54278 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS2P54278 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS2P54278 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS2P54278 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS2P54278 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS2P54278 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS2P54278 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS2P54278 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS2P54278 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS2P54278 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS2P54278 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS2P54278 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS2P54278 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS2P54278 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS2P54278 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS2P54278 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS2P54278 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS2P54278 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS2P54278 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS2P54278 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS2P54278 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS2P54278 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS2P54278 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS2P54278 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS2P54278 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P54278 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P54278 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P54278 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P54278 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P54278 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P54278 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms