Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 211.82□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 56
SUB1P53999 UBE2B-206ENST00000507277 644 ntTSL 55.62□□□□□ -1.516e-10■■■■■ 56
SUB1P53999 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 55.9
SUB1P53999 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 55.6
SUB1P53999 STAR-202ENST00000520114 3448 ntTSL 28.39□□□□□ -1.076e-11■■■■■ 55.6
SUB1P53999 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-28■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-208ENST00000527680 569 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-203ENST00000447216 980 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-205ENST00000525079 768 ntTSL 39.63□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 55.5
SUB1P53999 MRPL15-203ENST00000522521 853 ntTSL 54.62□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 55.5
SUB1P53999 ATP6AP2-223ENST00000637165 534 ntTSL 52.25□□□□□ -2.052e-8■■■■■ 55.5
SUB1P53999 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 55.5
SUB1P53999 DLD-203ENST00000417551 2041 ntTSL 53.03□□□□□ -1.925e-8■■■■■ 55.5
SUB1P53999 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.847e-8■■■■■ 55.4
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SUB1P53999 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 55.1
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SUB1P53999 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 23.44□□□□□ -1.861e-12■■■■■ 55
SUB1P53999 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.526e-11■■■■■ 54.9
SUB1P53999 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.586e-11■■■■■ 54.9
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SUB1P53999 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-14■■■■■ 54.7
SUB1P53999 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 54.5
SUB1P53999 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-207ENST00000496583 2372 ntTSL 218.05■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.453e-24■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -22e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 GFM1-201ENST00000264263 3453 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 GFM1-207ENST00000478254 3470 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 GFM1-210ENST00000486715 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 ATP6V1H-218ENST00000524164 1734 ntTSL 512.54□□□□□ -0.44e-15■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 CYFIP1-211ENST00000619348 3471 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-201ENST00000228740 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.057e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-210ENST00000553041 6109 ntTSL 24.12□□□□□ -1.757e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-203ENST00000537111 1881 ntTSL 1 (best)2.35□□□□□ -2.037e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 54.3
SUB1P53999 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 54.3
SUB1P53999 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.828e-10■■■■■ 54.2
SUB1P53999 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.728e-10■■■■■ 54.2
SUB1P53999 TOP2B-202ENST00000413971 2049 ntTSL 53.36□□□□□ -1.878e-10■■■■■ 54.2
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SUB1P53999 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 54.1
SUB1P53999 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.549e-8■■■■■ 53.9
SUB1P53999 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 53.9
SUB1P53999 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 25.06□□□□□ -1.62e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 23.52□□□□□ -1.852e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 RABGGTB-203ENST00000459697 1177 ntTSL 22.84□□□□□ -1.952e-11■■■■■ 53.8
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SUB1P53999 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 211.24□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 511.07□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 58.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-204ENST00000416073 2248 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-206ENST00000527892 2105 ntTSL 27.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.96e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-212ENST00000556167 601 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-208ENST00000554843 655 ntTSL 211.57□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-203ENST00000553688 787 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-207ENST00000554620 790 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.078e-8■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 26.49□□□□□ -1.372e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 53.2
SUB1P53999 MRPL11-206ENST00000534488 812 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 53.2
SUB1P53999 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 53.2
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