Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 211.82□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 56
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SUB1P53999 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 55.9
SUB1P53999 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 55.6
SUB1P53999 STAR-202ENST00000520114 3448 ntTSL 28.39□□□□□ -1.076e-11■■■■■ 55.6
SUB1P53999 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-28■■■■■ 55.6
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SUB1P53999 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 55.6
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SUB1P53999 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 55.5
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SUB1P53999 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.526e-11■■■■■ 54.9
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SUB1P53999 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 54.5
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SUB1P53999 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-207ENST00000496583 2372 ntTSL 218.05■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 54.4
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SUB1P53999 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 54.3
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SUB1P53999 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 53.8
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SUB1P53999 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 58.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-204ENST00000416073 2248 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 53.6
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SUB1P53999 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.96e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-212ENST00000556167 601 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-208ENST00000554843 655 ntTSL 211.57□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-203ENST00000553688 787 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-207ENST00000554620 790 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.078e-8■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 26.49□□□□□ -1.372e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 53.2
SUB1P53999 MRPL11-206ENST00000534488 812 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 53.2
SUB1P53999 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 53.2
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