Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A1P53007 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A1P53007 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A1P53007 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC25A1P53007 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms