Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORCP51449 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORCP51449 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORCP51449 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORCP51449 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORCP51449 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORCP51449 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORCP51449 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RORCP51449 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORCP51449 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORCP51449 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORCP51449 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORCP51449 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORCP51449 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORCP51449 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORCP51449 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORCP51449 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORCP51449 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORCP51449 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORCP51449 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORCP51449 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORCP51449 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORCP51449 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORCP51449 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORCP51449 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORCP51449 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORCP51449 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RORCP51449 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORCP51449 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORCP51449 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RORCP51449 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORCP51449 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORCP51449 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORCP51449 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORCP51449 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORCP51449 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORCP51449 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORCP51449 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RORCP51449 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORCP51449 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORCP51449 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORCP51449 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORCP51449 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RORCP51449 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORCP51449 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORCP51449 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORCP51449 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORCP51449 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORCP51449 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RORCP51449 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORCP51449 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORCP51449 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORCP51449 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RORCP51449 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORCP51449 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORCP51449 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RORCP51449 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORCP51449 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RORCP51449 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORCP51449 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RORCP51449 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORCP51449 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORCP51449 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RORCP51449 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORCP51449 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORCP51449 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORCP51449 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RORCP51449 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RORCP51449 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RORCP51449 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORCP51449 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORCP51449 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORCP51449 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RORCP51449 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RORCP51449 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms