Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 FCHO1-204ENST00000593870 567 ntTSL 413.32□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 413.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LGR6-206ENST00000487787 3377 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-207ENST00000469169 1817 ntTSL 213.27□□□□□ -0.299e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-214ENST00000439122 2338 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-206ENST00000395164 568 ntTSL 413.21□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 413.2□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-213ENST00000431054 724 ntTSL 413.12□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-208ENST00000469809 1512 ntTSL 313.08□□□□□ -0.319e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CEP83-207ENST00000547232 2166 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-217ENST00000486271 2842 ntTSL 213.01□□□□□ -0.339e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HS1BP3-204ENST00000415264 414 ntTSL 312.98□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPLN-201ENST00000216658 4182 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-204ENST00000587139 3256 ntTSL 512.87□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-223ENST00000495113 596 ntTSL 212.86□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-208ENST00000482331 980 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 REEP6-203ENST00000395484 611 ntTSL 512.83□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-216ENST00000451181 464 ntTSL 512.79□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.399e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-210ENST00000491815 658 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-210ENST00000622804 1976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-203ENST00000413976 348 ntTSL 412.43□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 212.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-205ENST00000407521 513 ntTSL 412.34□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 WDR37-204ENST00000436154 714 ntTSL 312.31□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-209ENST00000494260 696 ntTSL 312.29□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FNIP2-206ENST00000512986 2173 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 512.22□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP006222.1-203ENST00000441866 2256 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 61.8
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AARSP49588 MSH5-212ENST00000467319 688 ntTSL 211.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 61.8
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AARSP49588 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 61.8
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AARSP49588 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-209ENST00000595549 774 ntTSL 511.68□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FAM89A-203ENST00000494111 1576 ntTSL 511.66□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-206ENST00000467961 1323 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 61.8
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AARSP49588 TMBIM1-204ENST00000418569 589 ntTSL 311.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PFDN1-204ENST00000512707 798 ntTSL 211.59□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-209ENST00000437694 992 ntTSL 211.58□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FAM89A-202ENST00000466258 983 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GOT1-202ENST00000471741 716 ntTSL 211.57□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATP2A1-205ENST00000563975 545 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 511.46□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PFDN1-205ENST00000512925 900 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-205ENST00000465521 745 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 VPS8-225ENST00000492449 2980 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PFDN1-203ENST00000510217 1091 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IFT46-207ENST00000530872 1566 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FNIP2-203ENST00000504715 724 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-217ENST00000534157 706 ntTSL 411.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP006222.1-202ENST00000448958 2250 ntTSL 511.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 211.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 61.8
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