Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMAN1P49257 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMAN1P49257 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMAN1P49257 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN1P49257 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms