Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKI67P46013 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKI67P46013 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKI67P46013 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKI67P46013 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKI67P46013 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MKI67P46013 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKI67P46013 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKI67P46013 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKI67P46013 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKI67P46013 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKI67P46013 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKI67P46013 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKI67P46013 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKI67P46013 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKI67P46013 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKI67P46013 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKI67P46013 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKI67P46013 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MKI67P46013 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKI67P46013 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKI67P46013 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKI67P46013 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKI67P46013 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKI67P46013 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKI67P46013 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKI67P46013 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKI67P46013 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKI67P46013 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKI67P46013 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKI67P46013 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKI67P46013 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MKI67P46013 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
MKI67P46013 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKI67P46013 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MKI67P46013 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKI67P46013 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKI67P46013 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKI67P46013 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKI67P46013 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKI67P46013 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKI67P46013 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKI67P46013 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKI67P46013 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKI67P46013 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKI67P46013 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKI67P46013 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MKI67P46013 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKI67P46013 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKI67P46013 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKI67P46013 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKI67P46013 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKI67P46013 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKI67P46013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKI67P46013 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MKI67P46013 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MKI67P46013 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKI67P46013 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKI67P46013 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MKI67P46013 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKI67P46013 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKI67P46013 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKI67P46013 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MKI67P46013 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKI67P46013 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MKI67P46013 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKI67P46013 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKI67P46013 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKI67P46013 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKI67P46013 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKI67P46013 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MKI67P46013 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKI67P46013 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKI67P46013 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKI67P46013 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKI67P46013 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKI67P46013 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKI67P46013 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKI67P46013 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKI67P46013 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKI67P46013 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKI67P46013 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MKI67P46013 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MKI67P46013 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKI67P46013 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKI67P46013 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MKI67P46013 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKI67P46013 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms