Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA3P43357 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA3P43357 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA3P43357 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA3P43357 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA3P43357 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms