Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PBX2P40425 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PBX2P40425 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX2P40425 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX2P40425 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX2P40425 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX2P40425 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX2P40425 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PBX2P40425 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PBX2P40425 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PBX2P40425 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PBX2P40425 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PBX2P40425 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PBX2P40425 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PBX2P40425 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX2P40425 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX2P40425 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PBX2P40425 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX2P40425 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX2P40425 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX2P40425 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX2P40425 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PBX2P40425 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX2P40425 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX2P40425 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX2P40425 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PBX2P40425 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBX2P40425 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBX2P40425 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PBX2P40425 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX2P40425 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX2P40425 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX2P40425 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX2P40425 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX2P40425 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PBX2P40425 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PBX2P40425 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PBX2P40425 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX2P40425 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX2P40425 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX2P40425 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX2P40425 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX2P40425 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PBX2P40425 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PBX2P40425 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PBX2P40425 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PBX2P40425 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX2P40425 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX2P40425 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX2P40425 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX2P40425 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PBX2P40425 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX2P40425 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX2P40425 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX2P40425 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBX2P40425 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX2P40425 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBX2P40425 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX2P40425 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX2P40425 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX2P40425 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBX2P40425 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX2P40425 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX2P40425 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PBX2P40425 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX2P40425 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX2P40425 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBX2P40425 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX2P40425 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX2P40425 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX2P40425 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX2P40425 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBX2P40425 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 657.4 ms