Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COPB2P35606 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COPB2P35606 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COPB2P35606 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COPB2P35606 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COPB2P35606 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COPB2P35606 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COPB2P35606 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COPB2P35606 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COPB2P35606 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COPB2P35606 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPB2P35606 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COPB2P35606 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPB2P35606 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
COPB2P35606 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COPB2P35606 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COPB2P35606 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COPB2P35606 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COPB2P35606 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COPB2P35606 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COPB2P35606 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COPB2P35606 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COPB2P35606 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COPB2P35606 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPB2P35606 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPB2P35606 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPB2P35606 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPB2P35606 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPB2P35606 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COPB2P35606 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPB2P35606 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPB2P35606 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COPB2P35606 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COPB2P35606 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COPB2P35606 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COPB2P35606 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COPB2P35606 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COPB2P35606 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COPB2P35606 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COPB2P35606 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COPB2P35606 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COPB2P35606 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COPB2P35606 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COPB2P35606 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COPB2P35606 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COPB2P35606 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COPB2P35606 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COPB2P35606 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COPB2P35606 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COPB2P35606 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COPB2P35606 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COPB2P35606 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COPB2P35606 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COPB2P35606 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COPB2P35606 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COPB2P35606 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COPB2P35606 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COPB2P35606 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COPB2P35606 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COPB2P35606 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms