Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IVDP26440 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IVDP26440 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IVDP26440 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IVDP26440 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IVDP26440 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IVDP26440 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IVDP26440 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IVDP26440 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IVDP26440 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IVDP26440 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IVDP26440 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IVDP26440 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IVDP26440 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IVDP26440 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IVDP26440 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IVDP26440 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IVDP26440 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IVDP26440 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IVDP26440 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IVDP26440 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IVDP26440 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IVDP26440 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IVDP26440 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IVDP26440 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IVDP26440 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IVDP26440 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IVDP26440 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IVDP26440 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IVDP26440 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IVDP26440 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IVDP26440 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IVDP26440 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IVDP26440 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IVDP26440 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IVDP26440 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IVDP26440 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IVDP26440 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IVDP26440 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IVDP26440 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IVDP26440 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IVDP26440 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IVDP26440 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IVDP26440 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IVDP26440 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IVDP26440 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IVDP26440 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IVDP26440 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IVDP26440 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IVDP26440 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IVDP26440 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IVDP26440 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IVDP26440 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IVDP26440 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IVDP26440 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IVDP26440 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IVDP26440 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IVDP26440 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IVDP26440 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IVDP26440 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IVDP26440 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IVDP26440 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IVDP26440 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IVDP26440 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IVDP26440 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IVDP26440 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IVDP26440 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IVDP26440 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IVDP26440 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IVDP26440 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IVDP26440 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IVDP26440 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IVDP26440 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IVDP26440 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IVDP26440 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IVDP26440 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IVDP26440 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IVDP26440 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms