Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAX3P23760 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAX3P23760 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAX3P23760 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAX3P23760 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAX3P23760 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAX3P23760 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PAX3P23760 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAX3P23760 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAX3P23760 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAX3P23760 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAX3P23760 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAX3P23760 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAX3P23760 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAX3P23760 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAX3P23760 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAX3P23760 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAX3P23760 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAX3P23760 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAX3P23760 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAX3P23760 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAX3P23760 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAX3P23760 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAX3P23760 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAX3P23760 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAX3P23760 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAX3P23760 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAX3P23760 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAX3P23760 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAX3P23760 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAX3P23760 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAX3P23760 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PAX3P23760 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAX3P23760 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAX3P23760 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAX3P23760 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAX3P23760 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAX3P23760 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAX3P23760 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAX3P23760 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAX3P23760 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAX3P23760 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAX3P23760 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAX3P23760 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAX3P23760 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAX3P23760 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAX3P23760 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAX3P23760 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAX3P23760 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAX3P23760 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PAX3P23760 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAX3P23760 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX3P23760 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX3P23760 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX3P23760 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX3P23760 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX3P23760 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAX3P23760 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAX3P23760 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAX3P23760 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX3P23760 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX3P23760 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX3P23760 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX3P23760 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX3P23760 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAX3P23760 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX3P23760 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX3P23760 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX3P23760 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX3P23760 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAX3P23760 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAX3P23760 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAX3P23760 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAX3P23760 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX3P23760 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX3P23760 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX3P23760 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX3P23760 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAX3P23760 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAX3P23760 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAX3P23760 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAX3P23760 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAX3P23760 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX3P23760 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX3P23760 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX3P23760 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX3P23760 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAX3P23760 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAX3P23760 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAX3P23760 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PAX3P23760 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAX3P23760 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms