Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYN1P17600 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYN1P17600 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYN1P17600 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYN1P17600 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYN1P17600 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYN1P17600 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYN1P17600 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYN1P17600 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYN1P17600 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYN1P17600 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYN1P17600 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYN1P17600 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN1P17600 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN1P17600 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN1P17600 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYN1P17600 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYN1P17600 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN1P17600 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN1P17600 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYN1P17600 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN1P17600 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN1P17600 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYN1P17600 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYN1P17600 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYN1P17600 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYN1P17600 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SYN1P17600 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYN1P17600 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYN1P17600 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYN1P17600 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYN1P17600 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYN1P17600 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYN1P17600 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYN1P17600 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYN1P17600 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYN1P17600 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYN1P17600 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYN1P17600 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN1P17600 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN1P17600 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN1P17600 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN1P17600 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN1P17600 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYN1P17600 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYN1P17600 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYN1P17600 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN1P17600 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN1P17600 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYN1P17600 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYN1P17600 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYN1P17600 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYN1P17600 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYN1P17600 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYN1P17600 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYN1P17600 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYN1P17600 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYN1P17600 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYN1P17600 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms