Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CFTRP13569 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CFTRP13569 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CFTRP13569 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CFTRP13569 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
CFTRP13569 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CFTRP13569 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CFTRP13569 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CFTRP13569 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CFTRP13569 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CFTRP13569 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
CFTRP13569 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
CFTRP13569 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CFTRP13569 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CFTRP13569 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
CFTRP13569 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
CFTRP13569 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CFTRP13569 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CFTRP13569 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CFTRP13569 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CFTRP13569 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CFTRP13569 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CFTRP13569 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
CFTRP13569 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
CFTRP13569 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
CFTRP13569 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CFTRP13569 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CFTRP13569 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CFTRP13569 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CFTRP13569 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CFTRP13569 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CFTRP13569 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CFTRP13569 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CFTRP13569 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CFTRP13569 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CFTRP13569 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CFTRP13569 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CFTRP13569 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CFTRP13569 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
CFTRP13569 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CFTRP13569 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CFTRP13569 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CFTRP13569 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
CFTRP13569 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CFTRP13569 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CFTRP13569 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CFTRP13569 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CFTRP13569 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CFTRP13569 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
CFTRP13569 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CFTRP13569 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CFTRP13569 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CFTRP13569 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CFTRP13569 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CFTRP13569 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
CFTRP13569 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CFTRP13569 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CFTRP13569 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
CFTRP13569 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CFTRP13569 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CFTRP13569 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CFTRP13569 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CFTRP13569 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CFTRP13569 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
CFTRP13569 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CFTRP13569 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
CFTRP13569 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CFTRP13569 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CFTRP13569 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CFTRP13569 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CFTRP13569 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CFTRP13569 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CFTRP13569 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CFTRP13569 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CFTRP13569 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CFTRP13569 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CFTRP13569 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CFTRP13569 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CFTRP13569 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CFTRP13569 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CFTRP13569 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CFTRP13569 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CFTRP13569 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CFTRP13569 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CFTRP13569 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CFTRP13569 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CFTRP13569 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CFTRP13569 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CFTRP13569 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CFTRP13569 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
CFTRP13569 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CFTRP13569 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CFTRP13569 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms