Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBBP07437 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBBP07437 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBBP07437 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBBP07437 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBBP07437 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBBP07437 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBBP07437 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBBP07437 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBBP07437 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBBP07437 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBBP07437 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBBP07437 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBBP07437 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBBP07437 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBBP07437 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBBP07437 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBBP07437 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBBP07437 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBBP07437 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBBP07437 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBBP07437 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBBP07437 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBBP07437 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBBP07437 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBBP07437 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBBP07437 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBBP07437 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBBP07437 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBBP07437 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBBP07437 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBBP07437 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBBP07437 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBBP07437 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBBP07437 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBBP07437 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBBP07437 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBBP07437 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBBP07437 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBBP07437 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBBP07437 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBBP07437 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBBP07437 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBBP07437 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBBP07437 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBBP07437 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBBP07437 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBBP07437 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBBP07437 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBBP07437 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBBP07437 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBBP07437 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBBP07437 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBBP07437 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBBP07437 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBBP07437 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBBP07437 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBBP07437 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBBP07437 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBBP07437 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBBP07437 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBBP07437 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBBP07437 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBBP07437 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBBP07437 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBBP07437 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBBP07437 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBBP07437 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBBP07437 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBBP07437 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBBP07437 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBBP07437 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBBP07437 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBBP07437 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBBP07437 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBBP07437 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBBP07437 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBBP07437 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBBP07437 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBBP07437 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBBP07437 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBBP07437 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBBP07437 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBBP07437 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBBP07437 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBBP07437 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBBP07437 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBBP07437 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms