Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMG1P04279 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMG1P04279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMG1P04279 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMG1P04279 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms