Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA21P01568 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA21P01568 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA21P01568 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms