Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GASTP01350 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GASTP01350 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GASTP01350 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GASTP01350 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GASTP01350 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GASTP01350 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GASTP01350 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GASTP01350 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GASTP01350 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GASTP01350 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GASTP01350 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GASTP01350 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GASTP01350 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GASTP01350 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GASTP01350 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GASTP01350 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GASTP01350 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GASTP01350 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GASTP01350 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GASTP01350 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GASTP01350 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GASTP01350 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GASTP01350 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GASTP01350 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GASTP01350 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GASTP01350 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GASTP01350 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GASTP01350 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GASTP01350 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GASTP01350 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GASTP01350 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GASTP01350 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GASTP01350 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GASTP01350 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GASTP01350 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GASTP01350 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GASTP01350 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GASTP01350 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GASTP01350 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GASTP01350 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GASTP01350 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GASTP01350 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GASTP01350 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GASTP01350 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GASTP01350 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GASTP01350 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GASTP01350 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GASTP01350 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GASTP01350 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GASTP01350 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GASTP01350 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GASTP01350 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GASTP01350 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GASTP01350 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GASTP01350 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms