Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGDSO95455 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGDSO95455 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TGDSO95455 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TGDSO95455 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGDSO95455 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TGDSO95455 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGDSO95455 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGDSO95455 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGDSO95455 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TGDSO95455 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGDSO95455 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGDSO95455 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGDSO95455 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGDSO95455 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGDSO95455 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGDSO95455 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGDSO95455 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGDSO95455 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGDSO95455 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGDSO95455 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGDSO95455 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGDSO95455 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGDSO95455 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGDSO95455 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGDSO95455 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGDSO95455 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGDSO95455 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGDSO95455 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TGDSO95455 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGDSO95455 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGDSO95455 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGDSO95455 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGDSO95455 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGDSO95455 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGDSO95455 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGDSO95455 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGDSO95455 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGDSO95455 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGDSO95455 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGDSO95455 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGDSO95455 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGDSO95455 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGDSO95455 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TGDSO95455 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGDSO95455 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGDSO95455 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TGDSO95455 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGDSO95455 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGDSO95455 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGDSO95455 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGDSO95455 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGDSO95455 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGDSO95455 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGDSO95455 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TGDSO95455 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGDSO95455 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGDSO95455 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGDSO95455 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGDSO95455 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGDSO95455 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGDSO95455 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGDSO95455 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGDSO95455 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGDSO95455 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGDSO95455 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGDSO95455 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGDSO95455 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms