Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCTN3O75935 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCTN3O75935 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DCTN3O75935 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCTN3O75935 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms