Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC4O75487 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC4O75487 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC4O75487 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC4O75487 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC4O75487 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC4O75487 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC4O75487 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC4O75487 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC4O75487 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC4O75487 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC4O75487 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC4O75487 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC4O75487 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC4O75487 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC4O75487 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC4O75487 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC4O75487 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC4O75487 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC4O75487 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC4O75487 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC4O75487 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC4O75487 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC4O75487 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC4O75487 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC4O75487 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC4O75487 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC4O75487 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC4O75487 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC4O75487 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC4O75487 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC4O75487 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC4O75487 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC4O75487 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC4O75487 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC4O75487 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC4O75487 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC4O75487 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC4O75487 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC4O75487 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC4O75487 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC4O75487 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC4O75487 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC4O75487 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC4O75487 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC4O75487 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC4O75487 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC4O75487 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC4O75487 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC4O75487 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC4O75487 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC4O75487 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC4O75487 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC4O75487 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC4O75487 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPC4O75487 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC4O75487 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC4O75487 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC4O75487 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC4O75487 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC4O75487 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC4O75487 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC4O75487 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC4O75487 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC4O75487 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC4O75487 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC4O75487 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC4O75487 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC4O75487 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC4O75487 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC4O75487 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms