Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLOCKO15516 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLOCKO15516 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLOCKO15516 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1036.1 ms