Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
FANCAO15360 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
FANCAO15360 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
FANCAO15360 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FANCAO15360 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FANCAO15360 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
FANCAO15360 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
FANCAO15360 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
FANCAO15360 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
FANCAO15360 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
FANCAO15360 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FANCAO15360 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
FANCAO15360 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
FANCAO15360 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
FANCAO15360 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FANCAO15360 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FANCAO15360 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
FANCAO15360 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
FANCAO15360 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
FANCAO15360 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
FANCAO15360 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
FANCAO15360 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FANCAO15360 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FANCAO15360 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
FANCAO15360 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
FANCAO15360 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
FANCAO15360 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
FANCAO15360 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
FANCAO15360 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
FANCAO15360 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
FANCAO15360 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
FANCAO15360 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCAO15360 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
FANCAO15360 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCAO15360 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCAO15360 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCAO15360 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCAO15360 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCAO15360 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
FANCAO15360 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCAO15360 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCAO15360 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
FANCAO15360 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
FANCAO15360 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCAO15360 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCAO15360 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCAO15360 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCAO15360 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCAO15360 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
FANCAO15360 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCAO15360 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
FANCAO15360 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
FANCAO15360 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
FANCAO15360 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCAO15360 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
FANCAO15360 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCAO15360 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCAO15360 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
FANCAO15360 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCAO15360 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCAO15360 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCAO15360 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
FANCAO15360 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCAO15360 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCAO15360 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCAO15360 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
FANCAO15360 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FANCAO15360 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
FANCAO15360 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
FANCAO15360 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCAO15360 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCAO15360 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCAO15360 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
FANCAO15360 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
FANCAO15360 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
FANCAO15360 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FANCAO15360 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
FANCAO15360 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
FANCAO15360 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
FANCAO15360 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FANCAO15360 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
FANCAO15360 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
FANCAO15360 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
FANCAO15360 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
FANCAO15360 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
FANCAO15360 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms