Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARPC3O15145 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARPC3O15145 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARPC3O15145 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARPC3O15145 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARPC3O15145 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms