Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RGPD3A6NKT7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD3A6NKT7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD3A6NKT7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RGPD3A6NKT7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms